甲醇被大眾所熟知，具有毒性。工業酒精中大約含有4%的甲醇，若被不法分子當作食用酒精制作假酒，飲用后，會產生甲醇中毒。甲醇的致命劑量大約是70毫升。
甲醇的毒性對人體的神經系統和血液系統影響大，它經消化道、呼吸道或皮膚攝入都會產生毒性反應，甲醇蒸氣能損害人的呼吸道粘膜和視力。在甲醇生產工廠，中國有關部門規定，空氣甲醇的濃度限制為PC-stel=50mg/m3，PC-TWA=25mg/m3，在有甲醇氣的現場工作須戴防毒面具、工廠廢水要處理后才能排放，允許含量小于200mg/L的甲醇。
甲醇的中毒機理是，甲醇經人體代謝產生甲醛和甲酸（俗稱蟻酸），然后對人體產生傷害。常見的癥狀是，先是產生喝醉的感覺，數小時后頭痛，惡心，嘔吐，以及視線模糊。嚴重者會失明，乃至喪命。失明的原因：甲醇的代謝產物甲酸累積在眼睛部位，破壞視覺神經細胞。腦神經也會受到破壞，而產生性損害。甲酸進入血液后，會使組織酸性越來越強，損害臟導致衰竭。[8] 

毒性：屬低毒毒性。

急性毒性：LD50：5628mg/kg（大鼠經口），15800mg/kg（兔經皮）；LC50：82776mg/kg，4小時（大鼠吸入）；人經口5～10ml，潛伏期8～36小時，致昏迷；人經口15ml，48小時內產生視網膜炎，失明；人經口30～100ml中樞神經系統嚴重損害，呼吸衰弱，死亡。

亞急性和慢性毒性：大鼠吸入50mg/m3，12小時/天，3個月，在8～10周內可見到氣管、支氣管粘膜損害，大腦皮質細胞營養障礙等。

致突變性：微生物致突變：啤酒酵母菌12pph。DNA抑制：人類淋巴細胞300mmol/L。

生殖毒性：大鼠經口低中毒濃度（TDL0）：7500mg/kg（孕7～19天），對新生鼠行為有影響。大鼠吸入低中毒濃度（TCL0）：20000ppm（7小時，孕1～22天），引起肌肉骨骼、心血管系統和泌尿系統發育異常。

甲醇對人體有低毒，因為甲醇在人體新陳代謝中會氧化成比甲醇毒性更強的甲醛和甲酸（蟻酸）。

初期中毒癥狀包括心跳加速、腹痛、上吐（嘔）、下瀉、無胃口、頭痛、暈、全身無力。嚴重者會神智不清、呼吸急速至衰竭。失明是典型的癥狀，甲醇進入血液后，會使組織酸性變強產生酸中毒，導致衰竭。嚴重者是死亡。

然而，仍然有不少不法商人不顧生命安全，用含有甲醇的工業酒精勾兌假酒并出售。但是，酒中也有極微量的甲醇，是宿醉的原因之一。甲醇中毒可以用解毒。因為甲醇在中被酒精脫氫酶氧化成甲醛，然后形成甲酸。可以和甲醇競爭醇脫氫酶，而使人體有時間排除甲醇。

身體危害：對中樞神經系統有麻醉作用；對視神經和視網膜有特殊選擇作用，引起病變；可致代謝性酸中毒。

急性中毒：短時大量吸入出現輕度眼上呼吸道刺激癥狀（口服有胃腸道刺激癥狀）；經一段時間潛伏期后出現頭痛、頭暈、乏力、眩暈、酒醉感、意識朦朧、譫妄，甚至昏迷。視神經及視網膜病變，可有視物模糊、復視等，重者失明。代謝性酸中毒時出現二氧化碳結合力下降、呼吸加速等。

慢性影響：神經衰弱綜合征，植物神經功能失調，粘膜刺激，視力減退等。皮膚出現脫脂、皮炎等。

皮膚接觸：脫去污染的衣著，用肥皂水和清水徹底沖洗皮膚。

眼睛接觸：提起眼瞼，用流動清水或生理鹽水沖洗，就醫。

吸入：迅速脫離現場至空氣新鮮處。保持呼吸道通暢。如呼吸困難，給輸氧。如呼吸停止，立即進行人工呼吸，就醫。

食入：飲足量溫水，催吐或用清水或 1%溶液洗胃，就醫。

甲醇中毒，通常可以用解毒法。其原理是，甲醇本身無毒，而代謝產物有毒，因此可以通過抑制代謝的方法來解毒。甲醇和在人體的代謝都是同一種酶，而這種酶和更具親和力。因此，甲醇中毒者，可以通過飲用烈性酒（酒精度通常在60度以上）的方式來緩解甲醇代謝，進而使之排出體外。而甲醇已經代謝產生的甲酸，可以通過服用小蘇打（）的方式來中和。[9] 

迅速撤離泄漏污染區人員至安全區，并進行隔離，嚴格限制出入，切斷火源。建議應急處理人員戴自給正壓式呼吸器，穿防靜電工作服，不要直接接觸泄漏物，盡可能切斷泄漏源。防止流入下水道、排洪溝等限制性空間。小量泄漏：用砂土或其它不燃材料吸附或吸收，也可以用大量水沖洗，洗水稀釋后放入廢水系統。大量泄漏：構筑圍堤或挖坑收容，用泡沫覆蓋，降低蒸氣災害。用防爆泵轉移至槽車或專用收集器內，回收或運至廢物處理場所處置。[9] 

液體。高度易燃，其蒸氣與空氣混合，能形成爆炸性混合物。吞食后有毒。跟皮膚接觸有毒。吸入有毒。短期暴露有嚴重損傷健康的危險。

根據GB 30000-2013化學品分類和標簽規范系列標準（參閱第十五部分），該產品分類如下：易燃液體 ，類別 2；急毒性-口服 ，類別 3；急毒性-皮膚 ，類別 3；急毒性-吸入 ，類別 3；特定目標器官毒性-單次接觸 ，類別 1。

危險運輸編碼：UN 1230 3/PG 2

危險品標志： 易燃有毒

安全標識：S7/S16/S24/S45/S36/S37/S39

危險標識：R11/R23/R24/R25/R39

儲存于陰涼、通風良好的專用庫房內，遠離火種、熱源。庫溫不宜超過37℃，保持容器密封。應與氧化劑、酸類、堿金屬等分開存放，切忌混儲。采用防爆型照明、通風設施。禁止使用易產生火花的機械設備和工具。儲區應備有泄漏應急處理設備和合適的收容材料。

本品鐵路運輸時限使用鋼制企業自備罐車裝運，裝運前需報有關部門批準。運輸時運輸車輛應配備相應品種和數量的消防器材及泄漏應急處理設備。夏季好早晚運輸。運輸時所用的槽（罐）車應有接地鏈，槽內可設孔隔板以減少震蕩產生靜電。嚴禁與氧化劑、酸類、堿金屬、食用化學品等混裝混運。運輸途中應防曝曬、雨淋，防高溫。中途停留時應遠離火種、熱源、高溫區。裝運該物品的車輛排氣管必須配備阻火裝置，禁止使用易產生火花的機械設備和工具裝卸。公路運輸時要按規定路線行駛，勿在居民區和人口稠密區停留。鐵路運輸時要禁止溜放。嚴禁用木船、水泥船散裝運輸。[10]